Tout d'abord il faut savoir que les fluorochromes n'ont pas tous le même rendement, donc vous ne détecterez pas de la même façon un antigène avec le même anticorps couplé à des fluorochromes différents.

Voici un exemple trouvé dans un catalogue d'un fournisseur :

Rendement Fluorochromes

La conséquence de ceci est que vous devez choisir votre fluorochrome avec soin. Les antigènes les plus faiblements représentés doivent être révélés avec des anticorps couplés à des fluorochromes qui ont le meilleur rendement, tout en n'oubliant pas que certains appareils ne peuvent pas mesurer certains fluorochromes.

Souvenez vous que le rendement décroit dans cette ordre pour ces fluorochromes :

APC > PE > PE-Cy5 > PerCP-Cy5.5 >> FITC >> PerCP

Tout en n'oubliant pas que l'APC ne fonctionne qu'avec des lasers émettant dans le rouge.

Un très beau récapitulatif des fluorochromes sur le site du Salk Institute CCMI : Flow Cytometry : ICI

Pour plus de précisions sur les possibilités de divers fluorochromes, rendez vous sur le site de bdbiosciences : c'est ici

ou sur celui d'Invitrogen - Molecular Probes : c'est là

Un outil pour le design de vos panels - Chromocyte

Enfin un document très intéressant de chez Invitrogen : télécharger le document (format pdf)