Matériel :
Becton Dickinson, Beckman Coulter, Cytek :
1 Aurora CS, 4 lasers (407 nm,
488 nm, 561 nm, 638 nm), 30 fluorescences, unité
de clonage, PSM.
1
Aurora Analyseur, 4 lasers (407 nm, 488 nm, 561
nm, 638 nm), 30 fluorescences, PSM
1
Gallios (3 lasers 488, 638, 405 nm, 10 couleurs,
passeur d'échantillons)
1 Canto II (3
lasers 488, 638, 405 nm, 8 couleurs, passeur
d'échantillons)
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Plusieurs postes de retraitement des données avec les logiciels
suivants : FlowJo, Diva, Kaluza.
1 salle blanche en confinement L2 pour le tri cellulaire
Il est demandé, pour chaque
publication ayant nécessité l'utilisation de l'appareil, que le
service figure dans les remerciements.
Objectif :
L’objectif initial était d’ouvrir
un centre de cytométrie de flux performant, pouvant assurer
analyses et tris multiparamétriques. Intégré dans l’IRMB et
faisant partie de MRI, le laboratoire participe à la réalisation
de travaux des laboratoires régionaux. Ce laboratoire, qui ne
possède pas de thématique propre est largement ouvert vers la
communauté scientifique régionale : INSERM, CNRS, Université des
Sciences, Faculté de Pharmacie, IFREMER, IRD, CIRAD, INRA, ENSAM…
Ces dernières années, l’évolution technique du matériel a conduit
de nombreux laboratoires à analyser et purifier des cellules au
moyen des cytométres en flux pour mieux clarifier leur rôle ou
analyser leur contenu (protéine, ADN, ARN…), qu’elles soient
humaines, animales, végétales, bactériennes, marines… Les besoins
des laboratoires croissant avec l’évolution des technologies, de
nombreuses études nécessitent l’utilisation d’analyseurs et de
trieurs hautes performances.
Activité :
Le service de cytométrie en flux
est une structure qui fonctionne en service commun.
Ce qui distingue la CMF des autres
techniques préparatives est qu’elle offre la possibilité de
travailler simultanément sur plusieurs paramètres. Aucune autre
méthode, qu’elle soit physico-chimique (centrifugation en
gradient, élutriation) ou immunologique (panning, colonnes,
rosettes) n’offre cette polyvalence. Il est ainsi possible
d’analyser et de trier des populations sur une base
multiparamètrique : deux morphologies et jusqu’à dix
fluorescences sur les appareils du commerce de dernière
génération.
Dans l'immédiat les thématiques
suivantes (faisant appel à l’analyse par cytométrie en flux) sont
abordées en réponse aux demandes exprimées:
+l’étude de la prolifération de
divers types cellulaires (lignées, lymphocytes...) par le marquage
de l’ADN.
+l’analyse de populations
cellulaires marquées avec des anticorps monoclonaux (multiples
marquages).
+ la quantification de
protéines membranaires par l’utilisation de standards calibrés
(QIFIKIT).
+ étude de l’apoptose.
+l’étude de l’expression de
protéines en fonction du cycle cellulaire.
+l’étude du contenu en ADN de
plantes (citron, café, riz, pétunia...) au moyen des colorants
utilisés pour le marquage de l’ADN précédemment cités.
+Le tri cellulaire fait appel aux
techniques d’analyse précédemment citées.
Pour plus de détails sur ces thématiques, rendez-vous
ICI.
Expertise :
Le laboratoire a participé aux tests de divers appareils
des 2 plus gros constructeurs de cytomètres que sont Becton
Dickinson et Beckman Coulter.
Evénements
marquants :
1991 :
Achat du FACScan en complément du trieur Ortho 50H
1993 :
Remplacement du trieur Ortho par un trieur FACSVantage
Validation du programme Cellquest (béta-test pour la
société Becton Dickinson)
2000 :
Mise à jour du FACSVantage en FACSVantage SE TurboSort
(Financé par l’IGM)
Acquisition de l’unité de clonage du trieur (Financée en
partie par une équipe de l’IGH)
2001 :
Mise à jour des postes informatiques d’acquisition
2004 :
Remplacement du laser UV du trieur de cellules
2005 : Achat du trieur FACSAria
2008 : Déménagement du laboratoire au sein du
CHU dans l'Institut de Recherche en Biothérapies.
Arrêt du
FACSVantage
2009 : Arrivée de 2 nouveaux analyseurs Beckman
Coulter : Cyan et Gallios
2010 : Mise à la retraite du FACScan après 15
ans de bons et loyaux services.
2012 : Certification ISO9001
2014 : Upgrade fluidique du FACSAria qui devient
un FACSAria IIIu
2015 : Arrivée du FACSCanto II, double
certification ISO9001 et NF X 50-900, Installation d'un laser
Jaune dans le FACSaria IIIu.
2016 : Mise sous PSM Noroit du FACSAria IIIu
2019 : Sortie du
Cyan du plateau
2022 : Sortie de l'Aria IIIu du plateau
Arrivée du trieur
Cytek Aurora CS 4 lasers
2023 : Arrivée de l'analyseur Cytek Aurora 4 lasers